Некий научный Акселератор

Спин-офф аниме «Научный Рейлгун» фокусируется на персонаже по имени Акселератор, одном из семи эсперов пятого уровня в Академии-Сити. В начале сюжета Акселератор проходит восстановление после потери значительной части своих способностей, которая произошла во время событий, связанных с девочкой по имени Последний Заказ. Несмотря на его желание остаться в стороне, обстоятельства вынуждают его вернуться к активным действиям.

Поводом для его возвращения становится необходимость спасти девушку по имени Эстель Розенталь. Инцидент приобретает более серьёзный масштаб, когда выясняется, что за похищением стоит организация «Дисциплинарное Наказание». Эта группа рассматривает всех эсперов как угрозу, которую необходимо ликвидировать. Для достижения своих целей организация использует нестандартные методы, включая применение в качестве оружия тел погибших магов, помещённых в специализированные роботизированные костюмы.

По мере того как «Дисциплинарное Наказание» приступает к реализации своих планов в Академии-Сити, Акселератор оказывается вовлечён в противостояние. Ему, несмотря на нежелание принимать на себя роль защитника, предстоит использовать свои оставшиеся силы, чтобы противостоять угрозе. Исход конфликта зависит от его действий в сложившейся ситуации.