Хроники непобеждённого Бахамута

События разворачиваются в мире, где ранее существовала империя Аркадия. Главный персонаж — Люкс, бывший принц свергнутой правящей династии. Империя пала пять лет назад в результате восстания, ключевую роль в котором сыграл неизвестный «черный герой». На её территории теперь образовано новое государство — империя Атисмата. Люкс является пилотом боевой машины, распространенного в этом мире типа вооружения, и имеет репутацию непобедимого бойца, однако при этом его называют «непобежденным слабаком».

В ходе событий Люкс, который часто оказывается в неловких ситуациях при общении с девушками, знакомится с Лизшарт, принцессой империи Атисмата. Эта случайная встреча, вызвавшая недовольство принцессы, предоставляет Люксу шанс проявить свои способности. В результате он получает возможность поступить в академию Драг-Рыцарей — учебное заведение, готовящее элитных воинов.

Академия изначально предназначена исключительно для девушек, и обучение в ней становится для Люкса новым этапом. Его попадание в это заведение совпадает с нарастающей политической напряженностью в мире, что указывает на приближение крупномасштабного военного конфликта. Дальнейшее развитие сюжета связано с его адаптацией в академии и подготовкой к грядущим событиям.