Третий сезон продолжает историю Нацуки Субару, который пытается найти ответы на возникшие у него вопросы. Ранее он оказался в альтернативном мире, где существуют магия и ведьмы, и познакомился с девушкой по имени Эмилия. После этого Субару осознал, что его прежняя жизнь осталась в прошлом, и он оказался вовлечён в сложные события, способные изменить ход вещей в этом мире.
В ходе предыдущих событий Субару пришлось столкнуться с различными персонажами, включая как союзников, так и опасных противников. Этот опыт сделал его более осторожным. Действия главного героя теперь в значительной степени мотивированы желанием защитить Эмилию и других друзей, с которыми он успел сблизиться, ради них он готов на многое.
В новом сезоне Субару понимает, что его путешествие далеко от завершения, и ему предстоит сделать серьёзный выбор. Пока он противостоит могущественным врагам, стремящимся посеять хаос, другие противники ищут его слабые места. Параллельно главный герой пытается укрепить отношения с союзниками, которые помогают ему в поисках ключевых ответов.