Атри: Мои дорогие моменты

После смерти родителей и бабушки Икаруга остаётся один. В наследство он получает старый корабль и подводную лодку. Поскольку других средств к существованию у него нет, он вынужден самостоятельно заботиться о себе, используя это имущество. Вскоре Икаруга встречает девушку, которая также пытается получить наследство своей умершей бабушки, располагая лишь картой с координатами возможного местонахождения сокровища.

Икаруга и девушка отправляются на поиски по указанным координатам. Вместо ожидаемых денег или драгоценностей они обнаруживают старинный гроб, пролежавший несколько столетий. Приняв решение вскрыть его, они находят внутри существо, внешне напоминающее человека, но с признаками механической конструкции. Существо представляется как Атри и сообщает, что не помнит своего прошлого.

Икаруга и его спутница принимают решение помочь Атри восстановить утраченные воспоминания. Этот процесс приводит их к необходимости путешествовать и исследовать различные места, связанные с происхождением андроида. В ходе этих поисков персонажи сталкиваются с ситуациями, требующими решения технических и исторических загадок, что постепенно влияет на их собственные жизни и представления об окружающем мире.