Детектив Конан: Алое алиби

События сериала сосредоточены на девушке по кодовому имени Ноль Два. Она, как и другие персонажи в её окружении, идентифицируется подобным номером. В начале повествования у героини наблюдаются провалы в памяти неизвестного происхождения. Единственное, что она может чётко вспомнить — факт своего заключения. Предшествующие этому события стёрты из её памяти. Периодически Ноль Два видит фрагментарные воспоминания о женщине, исполнявшей роль матери. Эта женщина оказала значительное влияние на формирование личности девушки. Позже в памяти героини возникает эпизод, связанный с книгой с иллюстрациями, которую принесла её опекун.

Содержание книги не привлекло внимания Ноль Два, в отличие от изображений внутри неё. Выясняется, что несколько лет назад над героиней проводились нестандартные эксперименты в месте под названием «Сад». Это была специализированная лаборатория. Там Ноль Два встречает мальчика по имени Хиро, имеющего кодовый номер Ноль Шестнадцать. Они совместно предпринимают попытку побега из лаборатории, но их задерживают почти сразу. В этот момент Хиро даёт обещание жениться на Ноль Два.

После поимки память обоим беглецам была стёрта, что привело к взаимному забвению. Однако позже Ноль Два начинает вспоминать человека, к которому испытывала симпатию, и принимает решение разыскать его, используя для этого доступные ей средства.